Problemas de Java en Linux

Todo el que ha corrido algún programa basado en Java dentro de un sistema operativo Linux sabe que muchas veces ocurren problemas. He notado que esto pasa sobre todo con los navegadores de internet que ejecutan Java para correr algunas aplicaciones (como juegos por ejemplo) A veces es muy lento, en otras ocasiones se tranca y algunas veces ni siquiera carga.